读博第一年，文献管理是让我最头疼的事之一——PDF 散落在各处，引用格式每次都要手动调，找一篇三个月前读过的文章能花半小时。从 2021 年开始系统用 Zotero，现在文献库里有 2300 多篇，查找速度和引用效率都有本质提升。
为什么选 Zotero 而不是 Mendeley 或 EndNote
- Mendeley：被 Elsevier 收购后隐私政策受争议，且功能更新停滞
- EndNote：学生版需要购买（约 €100-140），功能强但学习曲线陡
- Zotero：完全开源免费，跨平台（Mac/Windows/Linux），活跃社区维护，插件生态丰富
安装和快速上手
- 在 zotero.org 下载桌面程序并安装
- 在 Chrome 或 Firefox 安装 Zotero Connector 扩展
- 注册账户，在桌面程序中登录同步
安装好后，打开任意 PubMed、Google Scholar、Nature 文章页面，点击浏览器右上角的 Connector 按钮（书架图标）——元数据和 PDF 一键保存到 Zotero，整个过程不到 5 秒。
我的分类和标签体系
顶层建 5-6 个大文件夹（对应研究主题，如”single-cell”、”method-development”），每个主题内再分”reviews”和”primary”两个子文件夹。
标签用于横向状态标记：
to-read：加入队列未读key：重要文章，写作时必参考ms1-cited：第一篇手稿已引用method：方法类文章
这样可以快速过滤”key + single-cell + review”的交集，找文章变得非常高效。
和 LaTeX / Word 整合
- LaTeX（Overleaf）：安装 Better BibTeX 插件，设置 cite key 格式（如 smith2023），导出 .bib 文件后上传 Overleaf，正文用
\cite{smith2023}引用，格式自动生成 - Word：安装 Zotero Word 插件，写作时工具栏点”Add Citation”选文章，参考文献列表自动更新，一键切换 APA/Nature/任何 CSL 样式
PDF 存储超出 300MB 怎么办
Zotero 云端免费给 300MB，PDF 文件很快用完。推荐配置 WebDAV 同步：坚果云（国内用户友好，有 WebDAV 支持，1GB 免费）在设置页面找到 WebDAV 地址，填入 Zotero 的”首选项 → 同步 → 文件同步”，选择”WebDAV”并填入坚果云地址和账户密码。配置后 PDF 无限存储，元数据仍用 Zotero 官方云同步。
